稻飞虱总体偏重至大发生，程度将明显重于近3年，发生面积4.3亿亩次，其中华南、江南、长江中下游稻区大发生，西南、江淮稻区偏重发生。稻纵卷叶螟总体偏重发生，发生面积3.2亿亩次，黔东、湘西、江南和长江中下游湖库、沿江稻区大发生，西南大部稻区中等发生。水稻螟虫总体中等发生，发生面积2.8亿亩次，其中二化螟在江南和长江中下游单双季稻混栽区和西南北部稻区偏重发生；三化螟在华南、西南北部稻区中等发生。稻瘿蚊在华南部分稻区、大螟在长江中下游部分稻区呈回升态势。

稻纹枯病偏重至大发生，发生面积2.7亿亩，其中华南、江南、长江中下游稻区大发生，西南北部和江淮稻区偏重发生，西南南部和东北稻区中等发生。稻瘟病总体中等，局部偏重发生，程度重于2015年，发生面积8,000万亩次，其中华南、西南东部、江南、长江中下游、东北等部分稻区偏重流行，感病品种有大流行的风险。稻曲病总体中等发生，江南、长江中下游和江淮稻区中、晚稻偏重发生，发生面积6,700万亩。水稻病毒病总体偏轻发生，发生面积800万亩，其中南方水稻黑条矮缩病在华南和江南稻区呈回升态势，局部地区存在偏重流行风险。水稻白叶枯病、水稻细菌性基腐病等细菌性病害在部分稻区发生范围扩大，水稻恶苗病等其他病害在部分稻区有一定程度发生，发生面积6,500万亩次。

二化螟冬前越冬虫源面积和基数偏高，全国虫源面积比2014年增加10.8%，华南南部、江南、长江中游、东北大部稻区亩活虫数为2,500～5,000头，其中江西、黑龙江亩活虫数同比增加34.8%、65.9%，具备偏重以上发生程度的虫源基数。“两迁”害虫2015年秋季回迁虫量比常年高8%，越南虫源地同我国虫源地一样，受厄尔尼诺气候事件影响，有利于来年“两迁”害虫的虫源积累。随着秸秆禁烧、自然还田等措施的大面积实施，稻瘟病、稻曲病、稻纹枯病等菌源基数不断积累，田间菌源量大，具备中等以上发生程度的菌源基础。

南方稻区单、双季稻混栽，以粗秆大穗、优质高产型品种为主，易形成适温高湿的田间小气候，且栽插期、生育期不整齐，桥梁田多，有利于水稻病虫辗转为害。同时，主栽品种抗病性参差不齐，部分地区感稻瘟病品种比例仍然较高，如四川、重庆、黑龙江局部达50%～60%；加之品种跨区域种植和同一品种多年连续种植，导致品种抗性退化和丧失现象时有发生，利于稻瘟病发生流行。目前生产上抗稻曲病品种仍较为缺乏，加之江南、长江中下游、江淮等稻区粳稻种植区域南移、扩大，利于稻曲病发生流行。