番茄条斑病毒病的症状主表现在果、叶、茎等部位，发病初期上部叶片呈现深浅绿色相间的花叶病状，茎秆上中部初为暗绿色下陷的短条纹，后期叶片表现为茶褐色的斑点或云纹，也有的叶脉坏死，由主脉向支脉发展；茎蔓上变成深褐色下陷的油浸状坏死条斑，变色部分仅限于表皮组织，并不深入茎内。果实受害后，果实畸形，果皮上产生不规则深褐色长形斑块，以后发展成褐色凹陷的油浸状坏死斑，坏死部分仅在表层，不深入果内部，但会龟裂腐烂并脱落 。这种类型的症状通常造成植株提前枯死，导致绝收。