早稻秧田合理施用化肥，对培育壮秧有重要作用。但如果施用不当，不仅会伤根、伤叶、烧苗，严重的还会造成死苗。因此，秧田施用化肥应注意“六不宜”。
　　不宜用尿素作基肥。尿素的有效成分高，其含氮量高达46%，用作秧田基肥，会影响种子发芽率，出苗不齐。因为尿素施入秧田土壤后，经尿酶作用转化成铵，从而逸出氨气，使幼根、幼芽受损伤；若施用数量大，浓度高时尿素会直接破坏种子或幼芽组织的蛋白质结构，明显影响种子的发芽和幼苗的生长。因此，秧田施用基肥做到早施，一般应以有机肥为主，化肥为辅，氮磷钾配合施用，如旱育秧一般每亩苗床施有机肥1500～3000公斤，在播种前10-15天，每平方米苗床施硫酸铵20克、过磷酸钙40克、氯化钾40克。化肥必须提前施，施用迟了容易产生肥害。
　　不宜边施化肥边播种。有的农户习惯于在作秧厢时，边作秧厢边施肥边播种，造成烧芽现象发生，甚至导致死芽补种；有的在播种时苗床施用含氯的复合肥料，且用量过大，加上梳耙不匀，使部分稻种与复合肥直接接触，影响发根而造成局部死苗。边播种边施化肥，导致烧芽的主要原因是化肥施入秧田后，尚未完合溶解、扩散或被土壤胶体所吸附，芽谷播后直接与未溶解的化肥接触，引起幼芽失水而烧芽，因此施化肥时不宜过量，最好在耙田后留些浅水施化肥，把秧田耙平，让肥、泥二者融合后再做秧厢，等到第二天耙平厢面后再播种。
　　不宜在雨天撒施碳铵作追肥。碳铵是常用的氮素化肥，可用作秧田施用。但因其性质不很稳定，在温湿度较高的情况下，容易分解成氨、二氧化碳和水，造成氮的损失。如果雨天或露水未干时秧田撒施碳铵，肥料沾在秧苗叶片上容易发生肥害，使秧苗叶片灼伤呈桔红色。所以，秧田施用碳铵，应在晴天傍晚或上午露水干后撒施，以免肥料沾在叶片上，同时必须撒得均匀，避免发生肥害而烧叶。
　　不宜在3叶期前用尿素作追肥。尿素含有缩二脲，土壤中含量过多时，对秧苗有毒害；但缩二脲在土壤中也能分解成氨，其分解速度与气候有关，气温高分解快，气温低分解慢。当早稻秧苗处在2叶至3叶期时，如果施用缩二脲含量在2%以上的尿素时，就容易发生毒害。因此，秧苗在4叶期前最好不要施用尿素，尤其是低温阴雨天气，更不宜用尿素作追肥。当秧苗长至4叶期后，可用尿素作追肥，但每亩每次用量不超过10公斤，同时秧田要保持田水3～4厘米。
　　不宜在寒潮期间施用苗肥。有的农户在寒潮期间或寒潮刚过时，用化肥作苗肥追下，特别是施用高浓度的化肥或人畜粪肥，这时秧苗生机尚未恢复，施用化肥容易使秧苗打旽，甚至导致萎蔫。施用苗肥，应待气温稳定回暖后，秧苗根叶开始伸长时才施肥。一般每亩先薄施一些腐熟的粪水，使秧苗转绿，待秧苗完全恢复生机后再施些适量速效氮肥，促进秧苗生长。旱育秧苗床肥力较高，养分充足，秧田期一般不追施肥料，如果秧苗瘦弱，在寒潮过后，气温稳定回暖后，必须将化肥溶于水中结合浇水施用。
　　不宜偏早或过迟施送嫁肥。旱育秧苗床肥力较高，原则上苗床期不追肥，若秧苗泛黄，必须检查原因，不能见黄就追施氮肥。因为缺肥不是泛黄的唯一原因，苗床温度过高，水分过多，土壤板结等都会造成秧苗泛黄。只有在当秧苗偏弱瘦时，可在秧苗1.5～2叶期施用少量“断奶肥”；在移栽起苗前3-5天追施一次“送嫁肥”，或用0.5～1%尿素液，在起苗前1-2天均匀喷施。湿润育秧的秧苗，“送嫁肥”一般在拔秧前4-6天施用，少于3天肥料吸收不到，失去送嫁肥的作用。超过7天，秧苗过多吸收肥料，生长过于嫩绿，插秧后易败苗，遇到低温容易出现僵苗。一般可每亩秧田用4～5公斤尿素作“送嫁肥”。