一、炭疽病
　　主要为害果实，叶片、果梗也可受害。果实染病，主要表现在果面有褐色水渍状圆形或不规则形的病斑，直径在1厘米左右，多数下陷，病健交界明显，斑面轮生黑色或橙红色小粒点。这种病斑干燥时易干缩、破裂，像虎皮一样吊挂着，故又名“虎皮病”。潮湿时果实表面溢出红色黏稠物，病果腐烂脱落。高温多雨发病重。排水不良、种植密度过大、施肥不当或氮肥过多、通风不好，都会加重发生和流行。成熟果和受伤果易发病。
　　防治方法：发病初期，及时喷洒50%多硫悬浮剂500倍液；或70%甲基托布津可湿性粉剂600～800倍液；或80%炭疽福美可湿性粉剂800倍液；或75%百菌清可湿性粉剂500～600倍液；或70%代森锰锌可湿性粉剂400～500倍液等，7-10天喷1次，连喷3次。
　　二、软腐病
　　主要为害果实，病害多发生在青果上，果皮初呈水浸状暗绿色斑，后变褐软腐，具恶臭味，内部果肉腐烂，果实变形，好像在袋子里装满了泥水，有的叫“一兜水”。后期果实失水后干缩，仅留下灰白色果皮挂在枝蔓上，稍遇外力即脱落。
　　防治方法：植株结果期雨前、雨后及时喷药防治，可用72%农用链霉素2000倍液，或新植霉素2000倍液，或77%可杀得可湿性粉剂600倍液，或60%百菌通可湿性粉剂600倍液，或30%氧氯化铜胶悬剂500倍液等，交替使用，每隔7-10天1次，连用2～3次。
　　三、病毒病
　　常见有花叶、黄化、坏死和畸形等四种症状。轻型花叶病叶初现明脉和轻微褪绿，或浓、淡绿相间的斑驳，病株无明显畸形或矮化，不造成落叶，重型花叶除表现褪绿斑驳外，叶面凹凸不平，叶脉皱缩畸形，甚至形成线叶，生长缓慢，果实变小，严重矮化。黄化：病叶明显变黄，出现落叶现象。坏死：病株部分组织变褐坏死，表现为条斑，顶枯，坏死斑驳及环斑等。畸形：病株变形，或植株矮小，分枝极多，呈丛枝状。
　　防治方法：碧护5000倍液+病毒A、病毒灵或病毒净400～500倍液于发病初期使用，7天喷1次，连喷3次。0.1%高锰酸钾或碧护或1%过磷酸钙溶液喷洒对花叶病毒也有一定的防效。
　　四、疫病
　　为害辣椒的根、茎、叶、果。植株挂果后最易受害。植株根茎部和茎及侧枝受害，产生暗褐色条斑，边缘不明显，条斑以上的枝条和叶很快枯萎，茎基部常发生褐色软腐，有时病部产生白色霉层。叶受害，叶片上产生暗绿色圆形病斑，边缘不明显，空气潮湿时，病症迅速扩展，病部可见到白霉，叶片部分或大部分软腐，易脱落。果实被害，病部呈暗绿色水浸状，软腐，边缘不明显，很快扩展到全果实，潮湿时，病果上密生灰绿色霉状物。高温高湿病害发生严重，特别是大雨之后天气转晴，气温急剧上升，病发生严重，此外重茬地、田间积水及大水漫灌，定植过密，株间通风透光不良，均有利于诱发本病。
　　防治方法：发现中心病株后，可选用50%甲霜铜可湿性粉剂500～600倍液、77%可杀得可湿性粉剂500倍液、75%百菌清可湿性粉剂800倍液+碧护5000倍液等喷雾防治，7-10天喷1次，连喷2～3次，严重时每隔5天喷1次，连喷3～4次。
　　五、白绢病
　　为害近地面的茎基部。发病时，茎基部初呈暗褐色水渍状病斑，后逐渐扩大，稍凹陷，其上有白色绢丝状的苗丝体长出，成辐射状，病斑向四周扩展，延至一圈后，便引起叶片凋萎、整株枯死。病部后期生出许多茶褐色油菜籽状的菌核，茎基部表皮腐烂，致使全株茎叶萎蔫和枯死。在6-7月份高温多雨天气，或时晴时雨天气，发病严重。
　　防治方法：发病初期，用40％五氯硝基苯可湿性粉剂600倍液，或77％可杀得三仟可湿性粉剂600倍液，或70％代森锰锌可湿性粉剂600倍液或70％甲基托布津可湿性粉剂600倍液+碧护5000倍液喷淋植株基部，交替使用，每隔7-10天1次，连用2～3次。
　　六、青枯病
　　发病初期仅个别枝条的叶片萎蔫，且在傍晚时可以恢复，后扩展至整株，导致全株死亡。枯死叶片不脱落，叶片呈淡绿色。病茎外表症状不明显，纵剖茎部维管束变为褐色，横切面保湿后可见乳白色粘液溢出，可区别于枯萎病。在高温高湿、重茬连作、地洼土黏、田间积水、土壤偏酸、偏施氮肥等情况下，该病容易发生。
　　防治方法：发病初期，预防性喷淋14%络氨铜水剂300倍液+碧护5000倍液；或77%可杀得可湿性微粒粉剂500倍液；或72%农用硫酸链霉素可溶性粉剂4000倍液碧护5000倍液，隔7-10天喷淋1次，连续防治3～4次 。