（一）辣椒炭疽病
　　1.症状
　　果实病斑褐色，中央稍凹陷，圆形或不规则形，水渍状，生有圆心轮纹，上面着生黑色小点，这些点色淡面小。潮湿时病斑周围有湿润的变色圈，干燥且易于缩破裂。叶上也可发病，病斑初期为水渍状黄色斑点，渐变褐色，中央灰白色，圆形或不规则形，生有小点。
　　2.防治方法
　　(1)实行3～5年轮作，在无病果植株上留种。
　　(2)种子消毒，以55℃热水浸种10分钟，立即移至冷水中冷却，然后催芽。或将种子在冷水中预浸10小时，再放在1%的硫酸铜溶液中浸5分钟，捞出后拌少量硝石灰或草木灰，中和后再播。
　　(3)增施磷、钾肥，防止氮素过多，植株衰弱徒长。
　　(4)药剂防治：果实接近成熟时，喷0.3%～0.5%石灰等量式波尔多液，或75%百菌清600倍液，或50%甲基托布津1000倍液，或“40L”抗菌剂500倍液，7～10天防治1次，要连续防治2～3次。
（二）辣椒疮痂病
　　该病又叫细菌性斑点病，俗称落叶瘟。除危害辣椒外，还危害番茄。
　　1.症状  幼苗叶片沿叶脉发病，呈畸形，病斑疮痴状。成株叶片发病，近似水渍状绿色斑点，扩大成圆形或不规则形，边缘暗褐色，稍凸起，中央褐色，稍凹陷，表皮粗糙，受害严重时，叶片发黄脱落。果实上发病，初为黑色小点，后成圆形、长圆形病斑，病斑周围有狭窄的淡绿色边缘，后稍隆起，呈疮痂状。
　　2.防治方法
　　(1)选留无病果种子，进行种子消毒（同炭疽病），还可用1：10链霉素浸种10分钟播种。
　　(2)秧苗期可喷0.2%～O.25%石灰等量式波尔多液，定植后喷0.3%～0.5%石灰等量式波尔多液，也可喷o.02%农用链霉素液，每7～10天喷1次，共喷2～3次。   
（三）青椒病毒病
　　1.症状  叶上产生黄绿相间的花叶，叶片皱缩，向上卷曲；有的形成叶片疱斑，黄化；也有的表现植株矮化，节间短，丛枝；有的发病后在茎上产生黑褐色条斑，早期落叶、落花、落果，果实小而坚实；有的果实皱缩隆起，黄绿镶嵌，畸形。
　　2.防治方法  选抗病品种，或进行种子处理，可用1%高锰酸钾浸种20-30分钟钟进行催芽播种，其他措施同一般病毒病防治方法。
（四）辣椒的主要虫害是棉铃虫
　　棉铃虫以幼虫蛀食幼果为主，也危害叶片、幼茎，被害椒果虫蛀后腐烂，脱落。成虫不直接危害作物，白天在枯叶或杂草丛中，夜间飞出，吸食花蜜，交配产卵，对萎蔫的杨树枝和紫外线有强烈的趋性，因此可诱杀成虫。
　　防治方法可利用杨树枝把、糖醋液性诱剂、黑光灯诱杀成虫。也可以在幼虫时，喷洒生物性杀虫剂，如BT乳剂、粉剂进行防治。但注意不能使用有机磷类剧毒农药，防止入食后中毒。