中国政府对化肥的进出口和市场价格也采取了很多干预措施。
     2004年——从2004年3月16日起，对尿素产品暂停出口退税政策；从2004年4月2日起，对磷酸二铵产品暂停出口退税政策。
     2005年——对尿素出口采取了严格的限制措施，继续对尿素、磷酸二铵等主要化肥产品暂停出口退税。从2005年1月1日至3月31日，对尿素定额征收每吨260元出口暂定关税。2005年6月1日至10月31日，尿素出口按30%征收关税，2005年11月1日至12月31日，按15%征收关税。
     2006年——从11月1日起，对肥料用硝酸钾、重过磷酸钙等16项化肥类产品实施1%的进口暂定税率，尿素等3项化肥类产品的关税配额税率暂定为1%。
     2007年——从2007年7月1日起，尿素和磷酸二铵两个品种不再享有出口退税政策，同时征收出口关税。2007年对尿素出口征收的是季节性暂定关税，具体标准为1～9月按出口额的30%征收，10～12月按15%征收。磷酸二铵从2007年6月1日开始征收，具体标准为1～9月出口关税税率为20%，10～12月为10%。
     2008年——进入2008年，中国政府更是对出口化肥政策进行了强力干预：
     年初政策是：尿素产品，2008年第一季度关税按照30%征收，第二、三季度按35%征收，第四季度按25%征收；2008年加征磷酸一铵的出口关税，磷酸一铵、磷酸二铵关税相同，第一季度按照20%征收，第二、三季度按照30%征收，第四季度按照20%征收。
     2008年4月14日调整为：自2008年4月20日至9月30日，对所有贸易形式、地区、企业出口的化肥类产品及部分原料，在现有出口税率的基础上，以出口价格为基础，加征特别出口关税，税率为100%。
     2008年8月30日调整为：自2008年9月1日起到年底，将氮肥及合成氨的特别出口关税上调至150%。
     2008年11月14日，对出口化肥制定了最新的出口政策。主要内容是：经过调整的税率为：旺季尿素、磷酸二铵、磷酸一铵、重钙的出口关税均为110%；对淡季出口化肥设定基准价格，淡季出口关税由125%～185%降低为10%～110%。方案执行日期由2008年12月1日至2009年月12月31日，规定尿素旺季为2009年2～6月、9月1日～11月15日，淡季为2008年12月、2009年1月、2009年7～8月、2009年11月16日～12月31日；重过磷酸钙旺季为2009年2～5月，淡季为2008年12月、2009年1月、2009年6～12月；磷酸一铵、磷酸二铵旺季为2009年2～5月、8～10月，淡季为2008年12月、2009年1月、2009年6～7月、2009年11～12月。尿素、磷酸一铵、磷酸二铵、重过磷酸钙淡季出口税率的计算公式为：（1.1-产品基准价格/产品出口价格）×100%，基准价格分别为：2300元/吨、3700元/吨、4000元/吨和3100元/吨。
     中国进出口化肥关税政策，走过了由出口退增值税，到取消出口退税，再到加征出口关税，再到加征特别出口关税的路程，体现了政府限制化肥出口、保障国内市场供应和让农民能买到肥的坚定决心。强力关税政策的出台，对抑制化肥大量出口，对稳定国内市场化肥供应量，保障农民能买得到化肥起到了至关重要的作用。