有机水稻是指在水稻的种植过程中不使用农药、肥料等化学合成的药品，而是采取一系列可持续发展的措施培育不具有任何农药的绿色水稻，但是这种水稻的种植也存在问题，因为它不使用化学农药，所以它的病虫害防治比较困难。
农业防治措施
1.精选稻种
在水稻种植过程中，很关键的一个环节就是选择品种。我们应该选择质量好、耐病虫害能力强的品种，但绝对不可以是转基因品种。有机水稻最好的品种是专门生产单位所培育的，首先要通过机械选种，去掉一些发育不良、质量不合格的种子。然后在晴天时放到外面晾晒，利用太阳辐射中的紫外线杀死种子外部我们肉眼看不到的细菌，此外我们还可以进行盐水选种，选择成熟度高又饱满的种子，提高秧苗的质量，从而保证种子最后的发芽率。
2.调整栽插期
水稻在生育期最容易遭受病虫害影响，所以我们应调整栽插期，使水稻的每个生长阶段和蚁螟盛孵期错开，避开或者减少病虫害所带来的损失，造成这个时期损害的病虫大多是三化螟和二化螟，它们都是内源性害虫，意思就是这些害虫常年集中在秧田里产卵，所以我们可以通过调整水稻的栽插期来减少这种病虫害的发生几率，通过这种方法可显著降低螟虫的危害，从而提高秧苗的成活率。
3.种植绿肥
绿肥和我们通常所说的肥料不同，它不但不是化学合成的，对人类没有危害，而且还有利于土壤自然地力的恢复和稻田中微生物群落的稳定，从而保证了有机水稻的肥料均衡供应，水稻在成熟后也能长势好看，植株不出现超量的游离态氮。研究表明，有机水稻在生长的前期阶段，种植豆科作物作为绿肥是比较合适的，例如紫云英，这种稻田的病虫害发生量仅为普通稻田的三分之一到二分之一，极大地降低了病虫害所带来的损害，另外，这样还可以保证病虫天敌数量的稳定，避免爆发大规模的病虫害。
4.加强田间管理
加强田间管理可以有效地控制有机水稻病虫害的发生，在水稻的生育早期进行适当地翻土和浇水可以达到灭虫、灭草的效果，基本上可以杀死大部分的越冬螟虫。水稻这一农作物的生长本身就需要大量的水资源，所以我们需要建立稻田的水生环境，在秧苗的返青期还可以利用此环境进行深水护苗、深水控虫，实践表明，这种措施极大地减少了病虫的数量，增加了其天敌的数量，使它们的数量保持动态平衡，另外也杜绝了水稻一些常见病的发生。
5.天敌控害
利用天敌昆虫来防治有机水稻的病虫害是一项十分有效的生物控制措施，通俗一点说就是充分发挥“一物降一物”的优势。例如我们前文中提到的二化螟、三化螟就可以用放养赤眼蜂和蜘蛛来防治。农田里的蜘蛛是水稻害虫的最大天敌，例如小黑蛛和拟水狼蛛等，它们捕食害虫的能力是很强的。例外一个常见的害虫天敌就是青蛙，在春季采集蛙卵，建立青蛙繁殖基地，当其长到一定大的程度时就可以放到稻田中去，需要注意的是，工作人员要保持稻田里有水，改进施肥技术，不能伤害田中的青蛙。
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