纵观生物农药的历史，许多生物农药都是在偶然的情况下被发现，最负盛名的Bt (苏云金芽孢杆菌)就差点与我们失之交臂。
　　日本明治维新之后，日本是最大的蚕丝产地和出产国。不过在19世纪和20世纪之交，一种叫做猝倒病的细菌性疾病袭击了该国的养蚕业。被感染的桑蚕突然就停止进食桑叶，随后出现颤抖的症状，很快侧倒死亡。这种病传染迅速，来势凶猛，几乎席卷了整个日本养蚕业。1901年，日本细菌学家石渡繁胤成功地分离出了“猝倒病”的病原体。在显微镜下，病原体细菌呈棒状，是一种杆菌。石渡将它命名为猝倒杆菌。不过石渡并没有更深入地研究下去，也没有及时发表研究结果，所以他的发现被埋没了。这是人类第一次错过了Bt。
　　10年后的1911年，德国科学家恩斯特•贝尔林纳经过仔细地研究，和石渡一样成功地分离出了病原体杆菌。不过他并不知道石渡曾经的发现，他根据发现地将其命名为苏云金杆菌（Bt）。巧合的是，贝尔林纳不久之后就把培养Bt的培养基弄丢了，他就放弃了进一步的研究。这可以说是人类第二类错过Bt。
　　不过幸运的是，又过了10多年，后来的研究人员在1927年重新从地中海粉螟中分离出了Bt。很快，科学家就发现一个重要的事实，Bt有极强的生物针对性，它能杀死鳞翅目昆虫，而对其他动物没有什么影响。
　　于是，Bt开始被用于控制有害生物。20世纪20年代末，美国政府试着用Bt控制森林害虫舞毒蛾，效果不错。欧洲也做了类似的尝试，法国在1938年成功地研制出第一个商业化的Bt杀虫剂。到了50年代，Bt作为绿色有机农药，在美国被大规模地应用，原因是当时发现其主要杀虫剂DDT很难降解，DDT虽对哺乳动物无急性毒杀作用，但是针对性不强，不仅能杀死节肢动物，还能在鸟类的身体中累积。所以更有针对性的Bt开始被大量应用在森林和农业害虫的防治上。在美国，数十年来，转Bt棉让杀虫剂的使用量降低了82％。而在中国，转Bt棉的种植也可以让农药的使用量降低60％～80％。
　　此外，Bt还对人类健康作出过重大贡献。通过大量地使用Bt扑灭黑蝇，成功避免了河盲病的传播。